《洞洞杂货店》是一部恐怖日常漫画，坐落在老城区的“洞洞杂货店”专卖一些来历不明的旧物——生锈的剪刀、缺角的镜子、开裂的娃娃。店主老陶是个总是笑容满面的秃顶老人，每个顾客买走东西后，都会在三天内遭遇一件离奇诡异的事件，但最终又会毫发无损地回来，从此生活发生某种微妙的变化。主角关月是一名女大学生，她为寻找失踪的室友而来，发现室友最后一次现身正是在这家店里买走了一面镜子。关月决定在此打工调查，却逐渐发现老陶卖的并不是物品，而是“霉运”与“好运”的交易中介。
关月在仓库深处找到一本旧账本，记录着近五十年来所有顾客的“交易详情”。老陶坦白他是一只“厄运貔貅”，靠收集人类的霉运为食，而卖出的物品则是他转化后的“幸运残余”。室友的失踪，是因为她买走了老陶的一缕记忆。
关月买了那面室友带过的同款镜子，镜子里浮现出室友被吸入黑暗的画面。她按照老陶的提示在午夜三点点燃蜡烛，室友的声音从镜子里传出：“别找我，我很好。”
一位顾客买走生锈剪刀后，接连三天每次剪东西都会剪出一个“洞”，最后他在剪指甲时剪掉了自己的一截时间——那天下午凭空消失了三小时。
一个小女孩买走开裂的娃娃，当晚娃娃在客厅里跳起了芭蕾，第二天小女孩的腿伤突然痊愈，但娃娃的裂缝却转移到了她的床头柜上。
关月来到杂货店调查室友去向，买下一面缺角镜子，当晚她看到镜子里自己的倒影在哭，而她自己并没有流泪。第二天倒影的笑容比她还灿烂。
关月从室友的遗物里找到一张发霉的收据，地址指向老城区一条从未听说过的小巷，她按图索骥找到了“洞洞杂货店”，门口的风铃在她踏入瞬间叮当作响。